Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl49Q9CQ40 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl49Q9CQ40 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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