Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nsmce3Q9CPR8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nsmce3Q9CPR8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nsmce3Q9CPR8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms