Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab27bQ99P58 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab27bQ99P58 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms