Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trem2Q99NH8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trem2Q99NH8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trem2Q99NH8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms