Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nus1Q99LJ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Nus1Q99LJ8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms