Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pls3Q99K51 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pls3Q99K51 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pls3Q99K51 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms