Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn16Q925N4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Cldn16Q925N4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cldn16Q925N4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cldn16Q925N4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Cldn16Q925N4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn16Q925N4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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