Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo1Q924W9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lmo1Q924W9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms