Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo1Q924W9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lmo1Q924W9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Lmo1Q924W9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lmo1Q924W9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Lmo1Q924W9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Lmo1Q924W9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Lmo1Q924W9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo1Q924W9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Lmo1Q924W9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Lmo1Q924W9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Lmo1Q924W9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Lmo1Q924W9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Lmo1Q924W9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Lmo1Q924W9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Lmo1Q924W9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Lmo1Q924W9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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