Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrif1Q923B3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms