Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim59Q922Y2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim59Q922Y2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim59Q922Y2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms