Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf7Q922B6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Traf7Q922B6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms