Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf3Q920N1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf3Q920N1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms