Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SncbQ91ZZ3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SncbQ91ZZ3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SncbQ91ZZ3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncbQ91ZZ3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncbQ91ZZ3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncbQ91ZZ3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncbQ91ZZ3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncbQ91ZZ3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncbQ91ZZ3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncbQ91ZZ3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SncbQ91ZZ3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SncbQ91ZZ3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms