Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx18Q91ZR2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms