Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y11

Pcdha9, Protocadherin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha9Q91Y11 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha9Q91Y11 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha9Q91Y11 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms