Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y02

Pcdhb18, Protocadherin beta-18, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb18Q91Y02 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb18Q91Y02 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb18Q91Y02 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb18Q91Y02 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb18Q91Y02 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb18Q91Y02 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb18Q91Y02 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb18Q91Y02 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb18Q91Y02 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb18Q91Y02 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb18Q91Y02 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb18Q91Y02 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb18Q91Y02 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms