Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmco4Q91WU4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmco4Q91WU4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms