Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csde1Q91W50 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csde1Q91W50 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csde1Q91W50 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms