Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd3Q91W18 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd3Q91W18 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms