Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmcd1Q8VEE1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmcd1Q8VEE1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms