Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc115Q8VE99 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms