Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE47

Uba5, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba5Q8VE47 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uba5Q8VE47 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uba5Q8VE47 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uba5Q8VE47 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Uba5Q8VE47 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uba5Q8VE47 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uba5Q8VE47 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Uba5Q8VE47 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uba5Q8VE47 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uba5Q8VE47 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uba5Q8VE47 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uba5Q8VE47 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uba5Q8VE47 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uba5Q8VE47 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uba5Q8VE47 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uba5Q8VE47 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uba5Q8VE47 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uba5Q8VE47 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uba5Q8VE47 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uba5Q8VE47 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uba5Q8VE47 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uba5Q8VE47 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uba5Q8VE47 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uba5Q8VE47 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uba5Q8VE47 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uba5Q8VE47 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uba5Q8VE47 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms