Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SnrkQ8VDU5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SnrkQ8VDU5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SnrkQ8VDU5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms