Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDQ9

Kri1, Protein KRI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kri1Q8VDQ9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kri1Q8VDQ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kri1Q8VDQ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kri1Q8VDQ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kri1Q8VDQ9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kri1Q8VDQ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kri1Q8VDQ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kri1Q8VDQ9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kri1Q8VDQ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kri1Q8VDQ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kri1Q8VDQ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kri1Q8VDQ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kri1Q8VDQ9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kri1Q8VDQ9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kri1Q8VDQ9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kri1Q8VDQ9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kri1Q8VDQ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kri1Q8VDQ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kri1Q8VDQ9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kri1Q8VDQ9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kri1Q8VDQ9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kri1Q8VDQ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms