Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDM4

Psmd2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd2Q8VDM4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd2Q8VDM4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd2Q8VDM4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd2Q8VDM4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd2Q8VDM4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd2Q8VDM4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd2Q8VDM4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd2Q8VDM4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd2Q8VDM4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd2Q8VDM4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd2Q8VDM4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd2Q8VDM4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd2Q8VDM4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Psmd2Q8VDM4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psmd2Q8VDM4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmd2Q8VDM4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmd2Q8VDM4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd2Q8VDM4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd2Q8VDM4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd2Q8VDM4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd2Q8VDM4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd2Q8VDM4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd2Q8VDM4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms