Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Uhrf1Q8VDF2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uhrf1Q8VDF2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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