Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kdm4cQ8VCD7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm4cQ8VCD7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm4cQ8VCD7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms