Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r200Q8R281 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r200Q8R281 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Vmn1r200Q8R281 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r200Q8R281 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r200Q8R281 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r200Q8R281 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r200Q8R281 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r200Q8R281 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r200Q8R281 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r200Q8R281 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Vmn1r200Q8R281 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Vmn1r200Q8R281 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r200Q8R281 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r200Q8R281 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r200Q8R281 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r200Q8R281 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Vmn1r200Q8R281 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r200Q8R281 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Vmn1r200Q8R281 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Vmn1r200Q8R281 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Vmn1r200Q8R281 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmn1r200Q8R281 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Vmn1r200Q8R281 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Vmn1r200Q8R281 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Vmn1r200Q8R281 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Vmn1r200Q8R281 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Vmn1r200Q8R281 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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