Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Impg1Q8R1W8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Impg1Q8R1W8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Impg1Q8R1W8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Impg1Q8R1W8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Impg1Q8R1W8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Impg1Q8R1W8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Impg1Q8R1W8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Impg1Q8R1W8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Impg1Q8R1W8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Impg1Q8R1W8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Impg1Q8R1W8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Impg1Q8R1W8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Impg1Q8R1W8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Impg1Q8R1W8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Impg1Q8R1W8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Impg1Q8R1W8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Impg1Q8R1W8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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