Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxn4Q8K3Q3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1326.3 ms