Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r188Q8K3N2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r188Q8K3N2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r188Q8K3N2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn1r188Q8K3N2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r188Q8K3N2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r188Q8K3N2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r188Q8K3N2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r188Q8K3N2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r188Q8K3N2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r188Q8K3N2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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