Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MyripQ8K3I4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MyripQ8K3I4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms