Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf39Q8K2Z2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf39Q8K2Z2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms