Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Depp1Q8K2F3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms