Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtmr3Q8K296 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms