Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spire2Q8K1S6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Spire2Q8K1S6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spire2Q8K1S6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms