Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cog3Q8CI04 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cog3Q8CI04 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog3Q8CI04 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog3Q8CI04 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog3Q8CI04 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog3Q8CI04 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog3Q8CI04 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog3Q8CI04 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog3Q8CI04 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog3Q8CI04 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cog3Q8CI04 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cog3Q8CI04 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cog3Q8CI04 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cog3Q8CI04 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cog3Q8CI04 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cog3Q8CI04 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cog3Q8CI04 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms