Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hpf1Q8CFE2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Hpf1Q8CFE2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hpf1Q8CFE2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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