Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snx8Q8CFD4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx8Q8CFD4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms