Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup88Q8CEC0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nup88Q8CEC0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup88Q8CEC0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms