Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pramef8Q8CE24 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Pramef8Q8CE24 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef8Q8CE24 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Pramef8Q8CE24 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Pramef8Q8CE24 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Pramef8Q8CE24 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Pramef8Q8CE24 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef8Q8CE24 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
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