Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc178Q8CDV0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms