Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo43Q8CDI2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms