Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac7Q8C2B3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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