Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx17Q8BVL3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx17Q8BVL3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx17Q8BVL3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
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