Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scfd2Q8BTY8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scfd2Q8BTY8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms