Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Pbrm1Q8BSQ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pbrm1Q8BSQ9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pbrm1Q8BSQ9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms