Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSA9

Tyw3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw3Q8BSA9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tyw3Q8BSA9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tyw3Q8BSA9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyw3Q8BSA9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms