Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Me3Q8BMF3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Me3Q8BMF3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Me3Q8BMF3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms