Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp1Q8BJQ2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp1Q8BJQ2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms